В каком смысле мы говорим "следовательно, дизайн" в случае обнаружения кода?

В абдуктивном.

Всё очень просто на самом деле:

1. Все знаковые дизайны имеют код.
2. Организмы имеют код.
3. Организмы -- знаковый дизайн.

Здесь слово знаковый употребляется в смысле термина знак, введенного Чарльзом Сэндерсом Пирсом. Желающие могут обратиться за разъяснениями сюда или сюда.

Это классическая абдукция. Позиция 3 называется абдуктивным выводом (гипотезой). Использование абдукции -- это вежливая уступка и проявление доброй воли со стороны разумнотворщиков по отношению к квалифицированным и благожелательно настроенным оппонентам. Появление знаковых систем помимо целенаправленного дизайна, то есть вследствие лишь естественных ненаправляемых, так наз. фундаментальных, природных взаимодействий (сильное и слабое ядерные, гравитационное, электромагнитное), не наблюдается и, более того, не может наблюдаться (хотя желающим сие пронаблюдать никто не запрещает пытаться это делать).

Объяснение наблюдения (п.2) "Организмы имеют код" строится на основе пп.1-3 перестановкой наблюдения (п.2) и гипотезы (п.3). Эта перестановка переводит абдукцию в обычный силлогизм:

1. Все знаковые дизайны имеют код.
2. Организмы -- знаковый дизайн.
3. Организмы имеют код.

На самом деле, по-хорошему, следовало бы использовать более сильное утверждение о том, что физическая реализация генетического кода с использованием аминоацилсинтетаз и транспортных РНК по адаптерному принципу (как, впрочем, и физическая реализация других биологических кодов) является формой особых неголономных символьных ограничений на движение частиц материи в организме, и что наличие разработчика у всякого кода, включая биологические (мн.ч.), имеет статус закона природы: случайность не строит адаптеров, и не знать этого просто неприлично.

— Константин Сергеевич… Кто это?!
— Станиславский.
— Станиславский умер в 1938 году, и не знать этого просто неприлично.
[кадр из кинофильма «Приходите завтра»]

«Адаптерный принцип» на рабоче-крестьянском означает вилку с розеткой, только в нанометровом диапазоне:

Вилка с розеткой в быту

Синтез белка на рибосомах. Иллюстрация:Wikipedia

Это, надеюсь, моя последняя запись по теме абдукции в приложении к дизайну организмов.