mns2012

1. Количество мусора в ДНК минимально (вероятно, равно нулю). Пример "мусорной" ДНК примечателен тем, с каким позором развалилась дарвинистская версия. Мы продолжаем наблюдать, как остатки этого песочного замка размываются ходом исследований.

Монография, посвященная так называемой гипотезе "мусорной" ДНК: Jonathan Wells, The Myth of Junk DNA.

2. Белковая функция в природных белках глобально оптимизирована.

По материалам uncommondescent.com, в частности, публикаций автора gpuccio, в особенности содержащих обсуждения результатов, опубликованных вот в этой статье: Yuuki Hayashi, Takuyo Aita, Hitoshi Toyota, Yuzuru Husimi, Itaru Urabe, Tetsuya Yomo: Experimental Rugged Fitness Landscape in Protein Sequence Space, plos.org

3. Топология филогенетических отношений между таксонами лучше моделируется графом зависимостей, чем деревом:

Оригинальная публикация: Winston Ewert: The dependency graph of life.

Обсуждение: здесь.

4. Эволюция идет по пути деградации биологической функции:

Michael Behe: Darwin Devolves.

John Sanford: Genetic Entropy and the Mystery of the Genome.

5. Эволюция имеет границы возможностей, которые исчерпываются генерацией максимум 140 функциональных бит. Наблюдаемая в биоте сложная функция многократно превышает этот оптимистический порог и поэтому не может быть объяснена как результат действия естественного отбора, наложенного на динамику случайных вариаций генотипа.

Дизайн-распознавание: Основные понятия, см. раздел "Функциональная информация".

6. Гипотеза универсального генома: (a) универсальный геном, кодирующий все основные программы онтогенеза многоклеточных, появился незадолго до Кембрия; (б) несмотря на то, что высшие таксоны многоклеточных реализованы с использованием универсального генома, они сильно различаются друг от друга фенотипически, потому что задействуют различные комбинации программ. Эта модель генерирует два предсказания, лабораторное тестирование которых выполнимо уже сегодня. Предсказание (1): значительная часть генетической информации, соответствующей биологическим функциям высших таксонов, в низших таксонах остаётся незадействованной, хотя присутствует, по предположению, в геномах как первых, так и вторых. Предсказание (2): включение некоторых латентных функций высших таксонов принципиально возможно в организмах, принадлежащих к низшим таксонам; к числу подобных функций относятся программы развития органов зрения или синтеза антител у морских ежей. По мнению автора, фасеточное зрение у гидр (полностью задействовать все преимущества которого гидры даже не могут физически, так как изображение фокусируется за пределами тела гидры) плохо объясняется в дарвиновской парадигме, тогда как в рамках гипотезы универсального генома этот биологический факт объясняется гораздо лучше (компактнее), а именно: как результат случайного включения в прошлом уже существовавших латентных функций. Прошу также обратить внимание на то, что подобная тестируемая гипотеза невозможна в рамках неодарвинизма. Это чрезвычайно важное обстоятельство.

Michael Sherman: The Universal Genome and the Origin of Metazoa.

7. Оптимизация хранения повторяющихся участков генетического кода (overlapping genes): исходя из практики программирования, которая подразумевает минимизацию использования памяти и дискового пространства для хранения подключаемых к разным программам исполняемых модулей, предполагается, что этот же подход используется и в организации генетического кода.

Подробности.

8. Hachimoji DNA: генетический код -- именно код, то есть набор логических соответствий кодонов аминокислотам, то есть логика, которая, будучи реализована химически, не сводится исключительно к химии. Поэтому предполагалось, что эти правила можно изменить. Возможность изменения правил кодирования была экспериментально подтверждена.

9. Cуществование кодовых паттернов, функция которых никак не связана с селективностью по Дарвину и, с точки зрения СТЭ, не нужна.